El Museo y Parque Arqueológico Cueva Pintada consta de tres unidades diferenciadas. Una primera que es el edificio museo donde se ubica la zona de acogida de visitantes, salas expositivas, laboratorios y almacenes para la custodia de materiales arqueológicos; una segunda, que comprende un espacio de 5.000 metros cuadrados, bajo una gran cubierta, en la que podrá admirarse en toda su amplitud el gran yacimiento; y una tercera, en la que se encuentran el aula didáctica y el depósito de herramientas y talleres.
Una pasarela perimetral permitir a los visitantes recorrer todo el complejo sin afectar a la conservación de los vestigios. Un cierre de cristal protege el mural de la Cueva Pintada.